Le Comité de Pilotage est un organe de concertation pour chaque site ou ensemble de sites Natura 2000. Mis en place par le préfet, il est le maître d’ouvrage de la démarche et remplit plusieurs tâches :
- Il désigne une collectivité comme structure porteuse du site pour assurer l’élaboration et la mise en œuvre du DOCOB
- Il pilote la préparation et l’élaboration du DOCOB
- Il valide les différentes étapes, modifications ou révisions du DOCOB
- Il suit la mise en œuvre des actions établies dans le DOCOB
Le COPIL regroupe l’ensemble des usagers du site Natura 2000:
- représentants des collectivités territoriales ou locales (élus)
- représentants des propriétaires et exploitants
- représentants de l’Etat
- gestionnaires (ONF...)
- et toutes structures associatives de protection de la nature ou sportives.
Lorsque l'animation du site est en cours, le COPIL peut être désigné par la suite comme Comité de Suivi du site Natura 2000.